وقال السيد الخامنئي:" تلقّيتُ ببالغ الحزن والأسى نبأ استشهاد الدكتور علي لاريجاني، أمين المجلس الأعلى للأمن القومي وممثل القيادة فيه، إلى جانب نجله العزيز وعدد من زملائه. لقد كان رحمه الله شخصيةً عالمة، بعيدة النظر، حكيمة وملتزمة، تمتلك خبرات واسعة في مختلف المجالات السياسية والعسكرية والأمنية والثقافية والإدارية، وقد شكّلت مسيرته الممتدة لما يقارب خمسة عقود حضورًا مميزًا في بنية النظام الإسلامي"

وأكد سماحته أن" اغتيال هذه الشخصية البارزة يعكس حجم مكانتها وما يكنّه أعداء الإسلام من حقد تجاهها. وليعلم أعداء الإسلام أن هذه الدماء الزكية لن تزيد شجرة النظام الإسلامي إلا قوةً وثباتًا، وأن لكل دمٍ ثمنًا سيدفعه القتلة المجرمون عاجلًا أم آجلًا"

وأضاف:"أتقدّم بأحرّ التعازي إلى زوجته الكريمة وأبنائه وسائر ذويه، ولا سيما اية الله سماحة الشيخ صادق آملي لاريجاني، سائلاً الله تعالى أن يتغمّدهم بواسع رحمته وأن يرفع درجاتهم في عليين".