وفي تصريح له، قال الإمام الخامنئي إن "انفجار مسجد منطقة خان أباد في قندوز اعتداءٌ مرٌّ وأليم"، وأضاف "لقد أحزنتنا حادثة الانفجار المأساوية في مسجد منطقة خان آباد بمحافظة قندوز والتي أسفرت عن وفاة عدد كبير من المصلين".

وأمل الإمام الخامنئي "من المسؤولين في البلد المجاور والشقيق أفغانستان أن يعاقبوا المتعطشين للدماء مرتكبي هذه الجريمة الكبرى واتخاذ الإجراءات اللازمة لمنع تكرار مثل هذه المآسي".

وفيما يلي نص البيان الصادر عن الإمام الخامنئي:
"بسم الله الرّحمن الرّحيم

لقد أفجعتنا الحادثة المريرة والكارثيّة لتفجير مسجد في منطقة خان آباد بمحافظة قندوز، التي أودت بحياة عدد كبير من المؤمنين المصلّين. 

من المتوقّع من مسؤولي البلد الجار والشقيق أفغانستان بصورة كبيرة أن يعاقبوا المرتكبين الدمويّين لهذه الجريمة العظيمة، وأن يحُولوا دون تكرّر مثل هذه الفجائع، وذلك باتّخاذ التدابير اللازمة. 

أسأل الله - جلّ وعلا - الرّحمة وعلوّ الدّرجات لشهداء هذه الحادثة، والشّفاء العاجل للمصابين، والصّبر والسّلوان لذويهم وأقاربهم".